1996年成立浙江万马药业研究开发中心至今，拥有各级各类专业技术人员100余人，同时还聘请了外籍专家6人、国内专家多人作为公司技术顾问。

公司以科技创新与进步为出发点，注重项目与市场的紧密结合，不断开发出具有良好社会效益与经济效益的新药，同时在化工中间体及保健食品等相关领域有了新的发展。

至今，在各级政府及上级主管部门的关心、支持下，经过广大科技人员的共同努力，已先后研制了四十余项新课题，获新药证书及批文11项，承担国家科技部创新项目专项资助2项。国家“九五”“十五”攻关各一项，省、市各级各类资助项目多项，研发中心致力于追踪研制全球卓越化学药品及中国传统中药，以皮肤病、肿瘤、糖尿病为重点，并注重缓释给药和喷雾给药制剂的研究，为我公司今后的发展打下了良好的基础。

    1996年-2001年研发中心实行项目经理制。2001年-2004年实行实验室制。至2004年11月30日研发中心共立课题40个，其中完成项目研究18个，对外转让项目9个，在研项目19个。研发中心成立至今已完成和在研的主要品种有：多西他赛及注射液、多西他赛冻干、盐酸阿扎司琼及注射液、阿那曲唑及片剂、盐酸非素非那定及片剂、芪明颗粒剂、左旋亚叶酸钙及注射用左旋亚叶酸钙、劳拉西泮及片剂等一系列项目。

    研发中心现有研究人员100余人，90%以上为本科及以上学历，外聘专家6名。

    研发中心下设注册部、合成室、分析室、制剂室、临床部、中药室等部门。